Skip to content

Choroba auto-zapalna z niedoborem antagonisty receptora interleukiny-1 czesc 4

2 miesiące ago

522 words

Dla osobników, u których określono genotyp IL1RN, H oznacza mutanta heterozygotycznego, typu dzikiego i mutanta homozygotycznego M. Panel B pokazuje strukturę eksonów IL1RN (izoformy 1) (czarne skrzynki) i sekwencje homozygotycznych mutacji (które są nazywane pod wykresami wraz z powstałą mutacją aminokwasów). Izolat genetyczny w północno-zachodnim Puerto Rico jest populacją założyciela dla delecji genomowej o masie 175 kb między zasadami 113,434,601 i 113,609,824 na chromosomie 2. Usuwa ona geny kodujące sześć genów powiązanych z interleukiną-1: IL1RN i geny kodujące rodzinę interleukiny-1, członkowie 9 (IL1F9), 6 (IL1F6), 8 (IL1F8), 5 (IL1F5) i 10 (IL1F10) (panel C). Centromer i region zainteresowania są pokazane na czerwono. Wszyscy dziewięciu pacjentów byli albo homozygotyczni pod względem mutacji wpływających na IL1RN (siedmiu pacjentów), albo mieli rodziców, którzy byli nosicielami heterozygotycznymi (dwóch pacjentów) (Figura 2A). Pacjent 1, z Nowej Funlandii, był homozygotyczny pod względem delecji 2 pz (c.156_157delCA) (Figura 2B), która spowodowała mutację zmiany ramki odczytu, N52KfsX25, a następnie włączenie 24 nieprawidłowych aminokwasów i kodonu terminacji. Oboje rodzice byli heterozygotycznymi nosicielami tej samej mutacji. Pacjenci od 2 do 6 pochodzili z trzech niepowiązanych rodzin o holenderskim pochodzeniu; trzy były homozygotyczne pod względem mutacji nonsensownej wpływającej na aminokwas w pozycji 77 (mutacja nukleotydów, c.229G . T, wynikowa mutacja aminokwasowa, E77X) (Figura 2B), a dwie pozostałe, których DNA nie było dostępne, miały ten sam fenotyp kliniczny i heterozygotyczni rodzice. Wszyscy holenderscy rodzice byli nosicielami tej samej mutacji. Pacjenci 7 i 8, z pokrewnej rodziny libańskiej, byli homozygotyczni pod względem mutacji nonsensownej (mutacja nukleotydowa, ok. 160 ° C . T, wynikowa mutacja aminokwasów, Q54X) (Figura 2B). Pacjent 9, z Puerto Rico, był homozygotyczny pod względem delecji około 175 kb na chromosomie 2q, który zawiera sześć genów z grupy powiązanych genów związanych z interleukiną-1: IL1RN i genów kodujących rodzinę interleukiny-1, członków 9 (IL1F9), 6 (IL1F6), 8 (IL1F8), 5 (IL1F5) i 10 (IL1F10) (Figura 2C).
Żadna z tych mutacji nie została znaleziona w próbkach DNA uzyskanych z panelu 364 białych kontroli z New York Cancer Project. Aby ocenić możliwość wystąpienia efektu założycielskiego, częstotliwość każdej mutacji, z wyjątkiem tej w rodzinie libańskiej, została przetestowana w próbkach DNA z kontroli z kraju pochodzenia pacjenta. W panelu 555 kontroli z Nowej Funlandii, 2 niosło mutację N52KfsX25 (częstość alleli, 0,2%). Nie znaleziono nosicieli mutacji E77X w panelu 351 kontroli holenderskich, ale ta grupa kontrolna nie była geograficznie dopasowana do holenderskich pacjentów, wszyscy pochodzili z małej enklawy w południowej części kraju. Jednak obecność tej samej mutacji w trzech niepowiązanych holenderskich rodzinach, które badaliśmy, silnie sugeruje efekt założycielski. Homozygotyczna delecja o masie 175 kb znaleziona u naszego pacjenta, którego rodzic pochodzi z izolowanej genetycznie populacji w północno-zachodniej części Puerto Rico, została również znaleziona w trzech niespokrewnionych nosicielach w grupie 119 kontroli z geograficznie dobranych populacji (częstotliwość alleli, 1,3% ).
Badania funkcjonalne
Rysunek 3
[hasła pokrewne: aids test, badanie u lekarza medycyny pracy jak wygląda, lekarstwo na bielactwo ]

Powiązane tematy z artykułem: aids test badanie u lekarza medycyny pracy jak wygląda lekarstwo na bielactwo